É pouco comum um clínico geral ter dificuldades em diagnosticar a acne. No entanto, pode ser confundido com a rosácea, especialmente quando a acne persiste até aos 40 anos de idade, como acontece em 7% das pessoas. É característico nos doentes com rosácea apresentarem eritrocianose, mas não comedões. O envolvimento do tronco é raro.

O eczema seborreico raramente deve ser confundido com acne. Embora possam estar presentes pápulas, há normalmente um passado de eritema e descarnação, com lesões semelhantes no couro cabeludo, costas e tronco. Cerca de 50% dos doentes têm uma história de atopia.

Uma lesão nodular persistente, particularmente no queixo, pode ser um quisto dentário mascarado sob a forma de acne.

Os exantemas acneiformes podem ocorrer em resposta a agentes externos e internos, como os esteróides utilizados por alguns atletas ou o danazol prescrito a mulheres com endometriose. As pomadas utilizadas por muitos afro-caraibianos para desfrisar o cabelo podem, à semelhança dos corticosteróides tópicos, provocar uma erupção relativamente monomórfica, papular e acneiforme.